La IyD en Israel se lleva a cabo principalmente en siete universidades, decenas de institutos de investigación públicos y gubernamentales, cientos de empresas civiles y militares, y también en centros médicos y por diversas firmas de servicio público, en campos como las telecomunicaciones, electricidad, producción de energía y administración de recursos hídricos.
Más del 80% de toda la investigación israelí publicable - y casi toda la investigación básica y la capacitación de investigación básica - se lleva a cabo dentro de las universidades. La Fundación Israelí de Ciencias (FIS), un ente legalmente independiente, es la principal fuente de financiamiento competitivo de investigación básica. Alrededor de 1.000 investigadores reciben subvenciones de la FIS, que se combinan con financiamiento de las universidades. La FIS financia también programas especiales, tales como la participación de Israel en la construcción del detector ATLAS para el Large Hadron Collider en el CERN y mejora la calidad de la investigación clínica a través de una novedosa serie de subvenciones para 'médicos-investigadores'.
Para financiar y coordinar iniciativas de investigación demasiado grandes para ser manejadas por cualquier otro ente existe TELEM, un foro voluntario formado por los científicos jefes del Ministerio de Industria y Comercio y el Ministerio de Ciencias y Tecnología, el presidente de la Academia Israelí de Ciencias y representantes del Consejo de Educación Superior, el Ministerio de Finanzas y otros. TELEM gestionó, y cuando fue necesario financió, la entrada de Israel en el Programa Marco de la Comunidad Europea, la membresía en la Instalación Europea de Radiación Sincrotón y la reciente iniciativa de Israel Internet II. Actualmente está considerando una nueva iniciativa en nanotecnología.
El gran número de patentes sacadas por las universidades de Israel es una medida de la efectividad de la relación entre las universidades y la industria.
Desembolso en IyD civil como porcentaje del PNB (2002)
