La croissance rapide de la population et l'essor constant des secteurs industriel et agricole ont contribué à la dégradation écologique, notamment dans la région côtière qui abrite plus de la moitié de la population d'Israël et la majeure partie de son industrie. Pour lutter contre la pollution des rivages de la Méditerranée et de la mer Rouge, Israël a adopté un programme multiforme comportant : inspection, législation, contrôle de l'application de la législation, nettoyage du littoral et coopération internationale, principalement dans le cadre du Plan d'action méditerranéen.
Dans des conditions de rareté de l'eau et de développement agricole et industriel intensif, la dégradation de la qualité de l'eau devient un problème critique. Les engrais chimiques, les pesticides, l'infiltration d'eau de mer, les effluents domestiques et industriels sont responsables de la pollution des nappes phréatiques. Le traitement des eaux usées destiné à neutraliser leur impact nuisible sur l'environnement et la santé publique et visant à fournir de l'eau d'irrigation est désormais hautement prioritaire. Le plan de gestion des eaux récemment adopté prévoit le dessalement de l'eau de mer et des eaux saumâtres, l'amélioration du traitement des eaux usées en vue de leur réutilisation, des systèmes efficaces de production, de conservation et d'alimentation en eau. Un programme d'assainissement des rivières polluées a été également lancé afin de les transformer en ressources d'eau douce pour mettre à profit leur valeur écologique et récréative. La qualité de l'eau potable fait l'objet de contrôles stricts.
Parmi les facteurs affectant la qualité de l'air : citons la production d'énergie, les transports et l'industrie qui ont tous trois connu un développement spectaculaire ces dernières années. Dans le processus de production de l'énergie, l'utilisation de combustible à faible taux de soufre a contribué à réduire considérablement les concentrations en dioxyde de soufre, mais les émissions polluantes liées à l'intensification de la circulation automobile ont sensiblement augmenté. L'essence sans plomb, les convertisseurs catalytiques et la diminution de la teneur en soufre du gasoil ont été introduits pour pallier ce problème. Un système de contrôle à l'échelle nationale fournit une information mise à jour quotidiennement sur la qualité de l'air dans l'ensemble du pays. Israël respecte également les résolutions internationales portant sur la diminution de l'ozone et les changements climatiques.
La rapide croissance de la population, l'élévation du niveau de vie et de la consommation se soldent par une hausse considérable du volume des ordures – de l'ordre de 4 à 5 % par an. Ces dernières années, la plupart des décharges illégales du pays ont été fermées et les déchets ensevelis de façon à préserver l'écologie. Les efforts portent actuellement sur une gestion intégrée des ordures qui comprendra compression, recyclage, récupération et incinération. Les dispositions adoptées récemment sur le recyclage encouragent l'adoption de technologies peu ou non polluantes.
La gestion des substances toxiques dite « du berceau au tombeau » est conditionnée par la délivrance d'autorisations, la réglementation et la supervision de toutes les étapes de la production, de l'utilisation, du traitement et de l'élimination des déchets. L'application de la législation en vigueur, la mise en œuvre d'un plan d'urgence en cas d'accident et la revalorisation du site national réservé aux déchets toxiques devraient réduire les dangers potentiels pour la santé et l'environnement.
L'application de la législation écologique et la sensibilisation du public au respect de l'environnement occupent une place prioritaire dans les programmes éducatifs, du jardin d'enfants à l'université. Le public participe à l'application de la législation dans ce domaine, et des préposés à la propreté et au bien-être des animaux sont habilités à dresser un procès-verbal en cas de violation des lois en vigueur. De plus en plus, des mesures d'ordre économique sont mises en œuvre pour promouvoir l'amélioration de l'environnement, que ce soit sous la forme de subventions aux industries qui investissent dans la prévention de la pollution, ou sous la forme de taxes et d'amendes aux pollueurs. Conformément aux principes du développement durable, des efforts sont déployés dans tous les secteurs économiques pour la conservation des ressources et la prévention de la pollution.