מזכירות האו"ם היא הגוף המנהלי והניהולי של האו"ם, והיא האחראית ליישום קווי המדיניות של הארגון. בראשה עומד המזכיר הכללי הנבחר על-ידי העצרת הכללית.
המזכירות היא צוות בינלאומי העובד במטה בנ"י ובמרכזים שונים בשטח (למשל אדיס-אבבה, ניירובי ובנגקוק) ומבצע את העבודה היומיומית של האו"ם. בעת מילוי תפקידם, אסור למזכ"ל ולאנשיו (בכלל זה, העובדים הזוטרים ביותר) לקבל הוראות אף ממשלה או גוף אחר שאינו שייך לאו"ם. עליהם לייצג אינטרסים בינ"ל, ללא העדפות כלשהן.
גופים מרכזיים במבנה המזכירות הם כדלהלן:
• לשכות המזכ"ל הכוללות את לשכת המנהלה של המזכ"ל ושל ענייני העצרת הכללית בראשות סגן המזכ"ל.
• לשכות סגני מזכירים לעניינים מדיניים ולענייני מועצת הביטחון.
• המחלקה לעניינים כלכליים וחברתיים.
עבודת המזכ"ל והצוות מגוונת כקשת הבעיות שבהן עוסק האו"ם: שירותים תיווך רשמי ובלתי רשמי, יישוב סכסוכים בינ"ל, ניהול מבצעי שמירה על השלום, איסוף מידע סטטיסטי, תרגום נאומים ומסמכים, והגשת שירותי מידע לאמצעי התקשורת.