מיד עם היוודע דבר הפיגועים נערך משרד החוץ, כפי שאירע לא פעם בעבר , במתכונת חירום. מרכז המצב של משרד החוץ נערך מיידית תוך גיוס כל משאבי המשרד הנחוצים והפעלתם בשילוב עם כוחות הביטחון והחרום.
שר החוץ שוחח טלפונית בשעות הלילה המאוחרות ובשעות הבוקר עם עמיתו המצרי לעדכון ותיאום פעולות החילוץ וההצלה ובמהלך השיחה העלה סדרת בקשות כגון :פתיחת מעברי טאבה לתנועה שוטפת של צוותי חילוץ וההצלה ללא בדיקת מסמכי נסיעה, פתיחתו ללא עיכובים של הגבול לישראלים המבקשים לחזור ארצה, בקשת אישור להכנסת אוטובוסים לפינוי ישראלים מכל סיני, בקשה למעבר אווירי למסוקי צה"ל ולכוח יחידת חילוץ וההצלה של פיקוד העורף.
בשגרירות ישראל בקהיר הוקם חפ"ק מיוחד, כשהשגריר הישראלי בקהיר אלי שקד, יצר קשר מיידי עם ראשי משרד החוץ והמודיעין הכללי המצרי.
במקביל שיגר משרד החוץ צוות משימה מיוחד לצד הישראלי של הגבול וצוות שני – מקהיר – לצד המצרי. כל הצוותים עוסקים במגעים, תיאומים, וטיפולים הנדרשים בכל צד. הצוותים הגיעו ליעדם בסביבות חצות. בשעת בוקר מוקדמת שוחח נציג משרד החוץ בשטח עם שר התיירות המצרי שהגיע למלון בטאבה וקיבל מהשר המצרי נתונים רשמיים ראשונים.
ראש החטיבה הקונסולרית של משרד החוץ , המהווה את הנציג הבכיר של המשרד בשטח, וגורמי משרד נוספים ביניהם גם דוברי ערבית מצויים בשטח על מנת להקל על המעבר לשני הכיוונים מעבר של כוחות החילוץ וההצלה הישראלים לצד המצרי, וכניסת הישראלים החוזרים מסיני ארצה).
המשרד יזם ותיאם גיוס אוטובוסים לפינוי המוני של ישראלים המבקשים לחזור ארצה מאיזור החוף ומכל רחבי סיני.
משרד החוץ עוסק גם בטיפול בכל הקשור בזיהוי הגופות, פינויים ושחרורן המיידי ארצה תוך תיאום מירבי עם הגורמים המצריים.
מרכז המצב של משרד החוץ ימשיך גם בימים הקרובים להיות ערוך במתכונת חירום כולל השארת הנציגים בשטח ככל שיידרש, וערוך להשיב למאות הטלפונים המגיעים מהציבור הרחב. בהן פניות לאיתור נעדרים, בירור מידע על פצועים ונפגעים ושאלות שונות.
המשרד יגביר את המעקב אחרי ישראלים בסיני, דיווח על נעדרים פצועים ואחרים, וימשיך פעולות התיאום מול הגורמים המצריים לסיום החילוץ והעברת הנפגעים לישראל כמו גם הסיוע לכל הישראלים הנמצאים בסיני ומבקשים לשוב ארצה.